Сергей Анатольевич Липовой родился 15 января 1960 г. в посёлке Садовое Багаевского района Ростовской области.
Окончив среднюю школу, работал на предприятиях в Ростове-на-Дону, одновременно учился в Ростовском учебном центре ДОСААФ СССР.
В 1979 году призван на срочную военную службу
1983 г. - окончил Сызранское высшее военное авиационное училище лётчиков.
Проходил службу в вертолётных частях Восточного и Среднеазиатского округов Пограничных войск
С 1983 г. - старший лётчик-штурман экипажа "Ми-8"
С 1984 года — командиром экипажа "Ми-8".
В 1984—1989 годах принимал участие в афганской войне, совершил более сотни боевых вылетов.
В 1992 году он окончил Военно-Воздушную академию имени Гагарина.
С 1992 года Липовой командовал вертолётной эскадрильей Среднеазиатского пограничного округа, с 1993 года — был заместителем командира вертолётного авиаполка Закавказского пограничного округа. Участвовал в первой чеченской войне. С января 1996 года Липовой командовал Душанбинским отдельным вертолётным авиаполком ФПС РФ в составе Группы российских погранвойск в Таджикистане. Участвовал в оказании помощи наземным силам, поиске групп боевиков и наркоторговцев, высадке десанта в ущельях.
27 сентября 1996 г. одна из российских пограничных застав Калай-Хумского погранотряда подверглась сильному обстрелу как с афганской, так и с таджикской территории. На помощь осаждённой заставе вылетел экипаж Липового, в который, кроме него, входили подполковник Юрий Ставицкий, капитан Игорь Будай и капитан Валерий Стовба. Когда вертолёт стал обстреливать боевиков, те ответили огнём из крупнокалиберных пулемётов, нанеся ему сильные повреждения. В воздухе погибли Будай и Стовба, однако оставшимся членам экипажа удалось обнаружить ведущую обстрел заставы батарею и при помощи звена вертолётов уничтожить её. Затем Липовой и Ставицкий с трудом довели вертолёт до аэродрома.
Указом Президента России от 14 декабря 1996 года за "проявленный героизм при выполнении воинского долга" полковник Сергей Липовой удостоен звания Героя Российской Федерации
Продолжал службу в авиации погранвойск.
С 1996 года он руководил отделом авиации Группы российской пограничных войск в Таджикистане.
Участвовал во второй чеченской войне.
2001 г. - окончил Военную академию Генерального штаба, после чего командовал авиацией Северо-Кавказского погранокруга.
2005 г. - в звании генерал-майора уволен в запас.
Живет в Москве
Работал генеральным директором авиакомпании "Интеравиа"